Jeremy Johnson | Prescott College

Jeremy Johnson

Ph.D.
Akademické prohlášení

Zajímal jsem se o ekologii lesa, když jsem vyrůstal v přední části pohoří Skalistých hor v Coloradu. Po ukončení bakalářského studia přírodních zdrojů na Colorado State University jsem několik let pracoval pro službu National Park Service a US Forest Service (obojí v Arizoně) a poté jsem dokončil doktorát z geografie zaměřený na genetiku lesních krajin na Texas A&M University. Zastával jsem pozici asistenta hostujícího asistenta na Texas A&M University, kde jsem vyučoval biogeografii, a společně jsem absolvoval postdoktorandské jmenování s University of Northern Arizona University v Lesnické škole a USDA Forest Service v Dorena Genetic Resource Center v Grove Grove v Oregonu. kde jsem byl schopen trávit svůj čas obklopený vysokými stromy tichomořského severozápadu.

Jsem lesní ekolog a genetik se širokým zájmem o výuku a výzkum zaměřený na pochopení prostorových a časových vzorců toho, jak lesy reagují na četné hrozby spojené s globální ekologickou změnou, specializací na používání geografických, krajinářských a genetických nástrojů a teorie. Konkrétně zkoumám vzorce pohybu rostlin prostřednictvím rozptylu semen, vzorce lokální adaptace a přirozené genetické rezistence k invazivním lesním chorobám. Mým cílem je zajistit dlouhodobé přežití lesů účinnými ochrannými zásahy a řízením školením příští generace ekologů a přírodovědců.

Vzdělání

2016 Ph.D., Texas A&M University

2011 MS, Texas A&M University

2004 BS, Colorado State University

Akademické schůzky

Společný postdoktorát 2017-2019, Forest Service USDA, Centrum genetické resorce Doreny / University of Northern Arizona University of Forestry

2016-2017 Hostující profesor, Texas A&M University, Katedra geografie

Publikace

V revizi nebo revizi

Moler EV, Bucholz ER, Heck E, Johnson JS, Page GFM, Sniezko RA, Waring KM, Wehenkel C, Whipple AV. Probíhá kontrola. Osivo provenience klima a simulované oteplování ovlivňují vlastnosti semen jihozápadní bílé borovice. Kanadský žurnál lesního výzkumu.

Rogers H, Aslan C, Beckman N, Shea K, HilleRisLambers J, Fricke E, Bronstein J, Brodie JF, Bruna E, Bullock JM, Cantrell S, Decker R, Effiom E, Gurski K, Hastings A, Hartig F, Johnson JS, Kogan O, Loiselle BA, Miriti M, Neubert MG, Pejchar L, Poulsen JR, Powell JA, Pufal G, Razafindratsima OH, Sandor M, Schupp EW, Snell RS, Strickland C, Zambrano J, Zhou J, Zurell D. Probíhá kontrola. Rozptyl osiva a predace semen - podceňované, ale kriticky důležité procesy. Rostliny AoB.

LaRue EA, Dodds W, Rohr J, Dahlin K, Thorp JH, Johnson JS, Hardiman BS, Rodriguez-Gonzalez MI, Keller M, Fahey R, Knott J, SanClements M, Atkins JW, Tromboni F, Chandra S, Parker G, Rose K, Liu J, Fei S. Přijato. Vývoj biologie makrosystémů. Hranice v ekologii a životním prostředí.

Publikováno nebo v tisku

2020

Sniezko RA, Johnson JS, Reeser P, Kegley A, Hansen E, Sutton W, Savin DP. 2020. Genetická odolnost vůči Phytophthora lateralis v Port-Orford-cedru (Chamaecyparis lawsoniana) - Základní stavební kameny pro program odporu. Rostliny, lidé, planeta. DOI: 10.1002 / ppp3.10081

Sniezko RA, Johnson JS, Savin DP. 2020. Posouzení trvanlivosti, stability a použitelnosti genetické rezistence k nepůvodnímu houbovému patogenu u dvou druhů borovic. Rostliny, lidé, planeta. DOI: 10.1002 / ppp3.49

2019

Rogers H, Beckman N, Hartig F, Johnson JS, Pufal G, Shea K, Zurell D, Bullock JM, Cantrell S, Loiselle B, Pejchar L, Razafindratsmia O, Sandor M, Schupp E, Strickland C, Zambrano J. V tisku Celkové disperzní jádro: Recenze a budoucí směry. Rostliny AoB.

Beckman NG, Aslan C, Rogers H, Kogan O, Bronstein J, Bullock JM, Hartig F, HilleRisLambers J, Zhou J, Zurell D, Brodie JF, Bruna E, Cantrell S, Decker R, Effiom E, Fricke E, Gurski K Hastings A, Johnson JS, Loiselle BA, Miriti M, Neubert MG, Pejchar L, Poulsen JR, Powell JA, Pufal G, Razafindratsima OH, Sandor M, Shea K, Schupp EW, Snell RS, Strickland C, Zambrano J. 2019. Pokrok v interdisciplinárním rámci pro studium rozptylové ekologie osiva. AOB Rostliny.

Johnson JS, Pufal G, Cantrell S, Cosner C, Hartig F, Hastings A, Rogers H, Schupp EW, Shea K, Yu X, Zurell D. 2019. Rychlé změny v rozptylových vlastnostech semen mohou modifikovat reakce rostlin na globální změny. Rostliny AoB. DOI: 10.1093 / aobpla / plz020 Výběr redakce

Aslan C, Beckman NG, Rogers H, Bronstein J, Zurell D, Hartig F, Shea K, Pejchar L, Neubert MG, HilleRisLambers J, Miriti M, Loiselle BA, Effiom E, Zambrano J, Schupp EW, Pufal G, Johnson JS, Bullock JM, Brodie JF, Bruna E, Cantrell S, Decker R, Fricke E, Gurski K, Hastings A, Kogan O, Powell JA, Razafindratsima OH, Sandor M, Schreiber SJ, Snell RS, Strickland C, Zhou J. 2019. Využití funkčních skupin rostlin k podpoře šíření ekologie a ochrany semen. AoB Rostliny. DOI: 10.1093 / aobpla / plz006 Výběr redakce

2018

Moler EV, Abakir A, Eleftheriou M, Johnson JS, Krutovský KV, Lewis L, Ružov A, Whipple AV, Rajora OP. 2018. Populační epigenomika: postupující porozumění fenotypové plasticity, aklimatizaci, adaptaci a nemocem. In: Rajora OP, ed. Populační genomika: koncepce, přístupy a aplikace: Springer. DOI: 10.1007 / 13836_2018_59

Johnson JS, Krutovský KV, Rajora OP, Gaddis KD, Cairns DM. 2018. Pokrok v biogeografii prostřednictvím populační genomiky. In: Rajora OP, ed. Populační genomika: koncepce, přístupy a aplikace: Springer. DOI: 10.1007 / 13836_2018_39

2017

Johnson JS, Chhetri PK, Krutovský KV, Cairns DM. 2017. Růst a jeho vztah k individuální genetické rozmanitosti horského hemlocku (Tsuga mertensiana) na alpské hranici na Aljašce: Kombinace dendrochronologie a genomiky. Lesy, 8: 418. DOI: 10.3390 / f8110418

Balkenhol N, Dudaniec RY, Krutovsky KV, Johnson JS, Cairns DM, Segelbacher G, Selkoe KA, von der Heyden S, Wang IJ, Selmoni O, Joost S. 2017. Genomika krajiny: Pochopení vztahů mezi environmentální heterogenitou a genomickými charakteristikami populací. In: Rajora OP, ed. Koncepty, strategie a aplikace populační genomiky: Springer. DOI: 10.1007 / 13836_2017_2

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Konganti K, Krutovsky KV. 2017. Krajina genomické vhledy do historické migrace horského hemlocku v reakci na změnu klimatu holocénu. American Journal of Botanany, 104: 439-450. DOI 10.3732 / ajb.1600262 Titulní foto

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Krutovský KV. 2017. Rozptýlení osiva v alpinské linii: Posouzení pohybu semen v ekotonu alpinské treeline. Ecosphere, 8: e01649. DOI: 10.1002 / ecs2.1649 (Cena Henry Cowles od American Association of Geographers, udělena každoročně výzkumníkovi za vynikající výsledky v publikovaném výzkumu v biogeografii)

2016

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Lafon CW, Krutovsky KV. 2016. Reakce rostlin na globální změnu: Biogeografie nové generace. Fyzická geografie, 37: 93-119. DOI: 10.1080 / 02723646.2016.1162597

2013

Johnson JS, Cairns DM, Houser C. 2013. Shromáždění vegetace pobřežních močálů v Galveston Bay: Statistiky pro východní Texas Chenier Plain. Mokřady, 33: 861-870. DOI: 10.1007/s13157-013-0443-8

Prezentace

Pozvané přednášky:

Johnson JS. "Jaké jsou šance?" - Rozpoznání interakce a dopadu nemocí a změny klimatu na borovici jihozápadní “Invited Talk May 1, 2019. Série seminářů lesnické školy severní Arizony. Flagstaff, AZ

Johnson JS. „Zdraví a genetika lesů: úvahy o návrhu výzkumu“ Pozvaný Talk March 20, 2019. Kalifornie státní univerzita, Dominquez Hills, ministerstvo geografie, Carson, CA

Johnson JS. „Nové hranice v lesnictví: Kombinace jevů, společných zahrad a genomiky krajiny pro řešení rezistence vůči chorobám a změny klimatu“ Pozval Talk August 7, 2018. Mezinárodní seminář IUFRO: Odolnost stromů proti hmyzu a nemoci: Realizace slibu v praxi, Mt. Sterling, OH

Johnson JS. „Posouzení rozptylu semen ve více měřítcích pomocí krajinné genetiky“ Pozvaná diskuse Říjen 5, 2017. Oregonská státní vysoká škola lesnická, katedra lesních ekosystémů a společnosti, Corvallis, OR

Johnson JS. „Lesy v pohybu: Perspektiva genetiky krajiny“ Pozvaná diskuse Září 15, 2017. Seminář série seminářů Katedra geografie a životního prostředí University of North Texas, Denton, TX

Johnson JS. „Lesy v pohybu“. Pozvaný Talk March 3, 2017. Jarní kolokvium Texas A&M University of Geography Série, College Station, TX

Johnson JS. „Lesy v pohybu“. Pozvaná přednáška Talk 6, 2017. Kalifornská státní univerzita, Fullerton, série seminářů ministerstva geografie, Fullerton, CA

Johnson JS. „Rozptýlení rozptylového omezení a variace genomu ve třech lesních druzích s využitím přístupu genomiky krajiny “Invited Talk July 24, 2015. Landcare Research - Seminář Series, Landcare Research, Lincoln, Nový Zéland

Johnson JS. "Geografie na periferii: Případ interdisciplinárního výzkumu ve věku genomiky." Přednáška představená na setkání Texas A&M University Geography Society, April 8, 2014, College Station, TX.

Vybrané prezentace konference:

Johnson JS, Sniezko RA, Waring KM. 2019. Hodnocení trvanlivosti, stability a použitelnosti genetické rezistence k nepřirozenému houbovému patogenu v pěti jehličkách. Příspěvek prezentovaný na 15. bienále konference vědy a managementu na náhorní plošině Colorado a jihozápadním regionu 9 - 12. září, Flagstaff, AZ

Johnson JS, Sniezko RA, Mackin H, Heck E, Lewine M, Brons D, Mccoy S, Kegley A, Page GFM, Haagsma M, Still C, Waring KM. 2019. Charakterizace genetické odolnosti vůči blistrové rezavě bílé borovice v jihozápadní bílé borovici. Papír, který bude předložen na 2019 IUFRO Genetika pěti jehličí 22-26 Červenec, Invermere, Britská Kolumbie, Kanada

Johnson JS Rozsáhlé prostorové vzorce hlavní genové rezistence u borovicové borovice jihozápadní až bílé borovice rezavé. Příspěvek prezentovaný na 2019 Severoamerický lesní ekologický workshop 23-27 červen, Flagstaff, AZ

Johnson JS, Waring KM, Wehenkel C, Leal Saenz A, Jacobs JJ, Sniezko RA. 2018. Je to v jejich genech - Identifikace vzorců genetické rezistence na puchýřovou rez v jihozápadní bílé borovici. Příspěvek prezentovaný na Národní shromáždění společnosti amerických lesníků 3-7 Říjen, Portland, OR

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM a Krutovsky KV. 2017. Zachovává rozptyl na velké vzdálenosti vysokohorskou linii? Příspěvek prezentovaný na Výroční konference americké asociace geografů, 5-9 duben, Boston, MA.

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM a Krutovsky KV. 2016. Rozptýlení osiva na vysokohorské linii: Disperze na dlouhé vzdálenosti udržuje vysokohorské tunely. Příspěvek prezentovaný na Výroční konference americké geofyzikální unie, 12-16 prosinec, San Francisco, CA.

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Krutovský KV. 2016. Historická reakce horského hemlocku na pleistocénní glaciace na jeho hranici rozsahu na Aljašce v USA. Příspěvek prezentovaný na Konference genomiky a stromové genetiky IUFRO, 30 květen - 4 červen., Arcachon, Francie

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Konganti K, Krutovsky KV. 2016. Rozmotání holocénních migračních procesů horského hemlocku na poloostrov Aljašský Kenai. 1st Místo: Papírová soutěž o biogeografii speciální skupiny. Příspěvek prezentovaný na Výroční konference americké asociace geografů, 29 březen - 2 duben., San Francisco, CA

Johnson JS, Gaddis, KD a Cairns DM. 2015. Odolnost krajiny nebo izolace vzdáleností: Reakce lesů na pleistocénní glaciace na Aljašce. 2nd Místo: Papírová soutěž. Příspěvek prezentovaný na Den TAMU GIS, 17 Listopad., College Station, TX

Johnson JS, Cairns DM a Gaddis, KD. 2015. Dopřejte svůj osud větru: Dálkové rozptýlení v Mountain Hemlock. Příspěvek prezentovaný na Výroční konference Asociace amerických geografů jihozápadu, 4-7 Listopad., San Antonio, TX

Johnson JS, Cairns DM, Gaddis KD, Krutovsky KV. 2015. Kdo je tvůj táta? Genomická demystifikace se šíří na aljašské hranici. Příspěvek prezentovaný na Peth III: Hory naší budoucnosti, 4-8 říjen., Perth Scotland

Johnson JS, Cairns DM, Gaddis KD, Krutovský KV, Konganti K. 2015. Genomika dálkového rozptylu v pohoří Hemlock. Příspěvek prezentovaný na Výroční konference Asociace amerických geografů, 21-25 April., Chicago, IL

Johnson JS, Cairns DM, Krutovsky KV a Goldberg DW. 2014. Geodetické přístupy v krajině v ekologické biogeografii: Případová studie využívající Douglas Fir (Pseudotsuga menziesii) na severozápadním Pacifiku. Příspěvek prezentovaný na Výroční konference Asociace amerických geografů, 8-12 duben., Tampa, FL

Johnson JS, Cairns DM, Krutovsky KV a Goldberg, DW. 2013. Integrace genetiky a genomiky do ekologické biogeografie: Případová studie využívající jedle Douglas (Pseudotsuga menziesii) na severozápadním Pacifiku. Příspěvek prezentovaný na Svazu jihozápadu České republiky Výroční konference American Geographers, 24-26 říjen., Nacogdoches, TX

Washington-Allen RA, Thompson SM, Hays DB, Delgado A, Li J, Brademan WT, Popescu S, Martínez Peña RM, Huber-Sannwald E, Brademan C, March RG, Johnson JS, Modala NR, Reeves MC, Mitchell JE a Kulawardhana RW. 2013. Přehled použití technologií dálkového průzkumu Země k posouzení produkce a degradace suchozemské půdy na místní až globální úrovni. Příspěvek prezentovaný na Konference mexické společnosti ekologie, 18-22 March., Villahermosa, Tobasco Mexico

Washington-Allen RA, Johnson JS, van Riper C, Modala N, Barnes M, Brademan C, Bruton R, Delgado A, Kim J, March R, Saenz N, Srinivasan S, Reeves MC. 2012. Monitorování a hodnocení suchozemských oblastí USA. Příspěvek prezentovaný na Výroční konference americké geofyzikální unie, 3-7. Prosince, San Francisco, CA

Johnson JS, Cairns DM a Houser C. 2012. Marsh vegetační shromáždění East Bay of Galveston Bay: hierarchická klasifikace. Příspěvek prezentovaný na Výroční konference Asociace amerických geografů, 24-28 únor., New York, NY

Johnson JS, a Cairns DM. 2011. Měnící se vegetační dynamika pobřežního močálu: Galveston Bay, Texas. Příspěvek prezentovaný na Výroční konference Asociace amerických geografů, 12-16 duben., Seattle, WA

Vybrané prezentace plakátů (*označuje autora bakalářského studia):

Haagsma M, Page, GFM, Johnson JS, Stále C, Waring KM, Sniezko RA, Selkor J. 2019 Objektivní identifikace nemocných rostlin z hyperspektrálních obrazů pomocí strojového učení. Plakát představený na Americká geofyzikální unie, 9. - 13. prosince, San Francisco, CA

Waring K, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M, Justin Bagley, Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Friedline C, Garms C, Heck E, Haagsma M, Johnson JS, Page, G, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M a Moler E. 2019. Přizpůsobení a aklimatizace stromu na nemoc a ariditu. Plakát představený na PI-setkání NSF Macrosystems Biology Biology , 15-17 květen, Boulder, CO

Haagsma M, Page, GFM, Johnson JS, Stále C, Selkor J. 2018. Použití hyperspektrálních snímků k detekci invazního fungálního patogenu a stanovení závažnosti příznaků v Pinus strobiformis sazenice. Plakát prezentovaný na Americká geofyzikální unie, 10-14 Prosinec, Washington, DC

Johnson JS, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M, Justin Bagley, Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Haagsma M, Heck E, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M, Moler E, Page G a Waring K. 2018. Adaptace a aklimatizace stromu na nemoc a ariditu. Plakát představený na IUFRO 6th Mezinárodní seminář o genetice interakcí strom-parazit: Odolnost stromů proti hmyzu a chorobám: uvedení slibu do praxe, 05-10 srpen, Mt. Sterling, OH

Waring K, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M, Justin Bagley, Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Friedline C, Garms C, Heck E, Johnson JS, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M a Moler E. 2018. Adaptace a aklimatizace stromu na nemoc a ariditu. Plakát prezentovaný na PI-setkání NSF Macrosystems Biology Biology , 08-10 Leden, Alexandrie, VA

Waring K, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Friedline C, Garms C, Heck E , Johnson JS, Leal Saenz A, McTeague B., Menon M a Moler E. 2017. Míchání ekologie a evoluce pomocí vznikajících technologií k určení distribuce druhů s nepůvodním patogenem v měnícím se klimatu. Plakát prezentovaný na IUFRO: Regenerace lesů v měnícím se prostředí, 11-13 červenec, Corvallis, OR

Gaur K*, Brandon Mann W*, Hou D*, Nolasco C*, McAfee L*, Hingrajiya K*, Johnson JS, a Chhetri PK. 2016. Vzorek růstu prsten stromu Abies spectabilis z podhorského lesa lovecké rezervy Dhorpatan, západní Nepál. Plakát prezentovaný na Jihozápadní divize americké asociace geografie výroční konference, 20-22 říjen, Denton, TX

Johnson JS, Cairns DM, Gaddis a Konganti K. 2015. Tok genů na vysokohorské hranici: Odkud tato semena pocházejí? Vítěz: 1st místo (kategorie: Genetika a genomika). Plakát prezentovaný na Texas &&M institut pro genomické vědy a sympozium společnosti, 8-9 říjen., College Station, TX

Johnson JS, Cairns DM † a Krutovsky KV. 2014. Genetika krajiny a tok genů v Coastal Douglas-Fir (Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco var. menziesii. Plakát prezentovaný na MtnClim, 15-18 září., Midway, UT

Johnson JS, Krutovský KV, Cairns DM a Goldberg, DW. 2014. Charakterizace a vizualizace toku genů v Coastal Douglas-Fir (Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco var. menziesii): Krajina genetický přístup Plakát představený na Národní konference Ekologická společnost Ameriky, 10-15 srpen., Sacramento, CA

Johnson JS, a Cairns DM. 2010 Vegetace klasifikace pobřežní slané bažiny: Galveston Bay, Texas. Plakát představený na Jihozápadní divize konference Asociace amerických geografů, 14-16 Říjen., Tahlequah, OK

Ocenění, granty a vyznamenání

Granty

Lesní služba 2020-2021 USDA - Účinnost hlavní genové rezistence v oteplovacím klimatu pro pět jehličí. (Co-Pi s RA Sniezkem) ($ 75,000)

2019-2021 USDA Ochrana zdraví lesů: Projekt vývoje speciálních technologií - Včasná identifikace příznaků onemocnění blistrové rezy bílé borovice borovice vývojem levné vysokorychlostní fenotypovací platformy (PI, s Co-PI K Waring, G Page, C Still, M Haagsma, J Selkor, R Sniezko) ($ 349,077)

Národní vědecká nadace 2018 - Výzkumné zkušenosti pro vysokoškoláky - Biologie makrosystémů: Míchání ekologie a evoluce pomocí rozvíjejících se technologií k určení distribuce druhů s nepůvodním patogenem v měnícím se klimatu: jihozápadní bílá borovice (Pinus strobiformis) (Co-PI s PI C stále) ($ 6,750)

2015 Národní vědecká nadace - Východní Asie a Pacifikské letní institutové stipendium, Nový Zéland EAPSI: Posouzení omezení šíření osiva jako příčiny náhlých treelin na Novém Zélandu ($ 9000)

2013-2015 Národní vědecká nadace Doktorandská disertační práce Výzkumný grant na zlepšení - geografie a prostorové vědy DDRI: Genetický přístup k rozptylu v ektonu alpine treeline (Co-PI, s DM Cairns) ($ 15,987)

2013-2014 Texas A&M Institute of Genome Sciences and Society Fellowship. Texas A&M University Genomický přístup k rozptylu semen v ekotonu alpské treeline a jeho důsledky pro měnící se klima ($ 22,000)

Ocenění

2018 Henry Cowles Award od American Association of Geographers, udělovaná každoročně výzkumníkovi za vynikající výsledky v nedávno publikované výzkumné práci v biogeografii: pro Rozptýlení osiva na alpinské linii: hodnocení pohybu semen v ekotonu alpine treeline. Ecosphere

2016 Best PhD Paper Presentation: Americká asociace geografů Biogeografická speciální skupina

2015 Chimborazo PhD Student Research Award: Americká asociace geografů Mountain Geography Special Group:

Nejlepší prezentace 2015 Texas A&M Institute for Genome Sciences and Society v kategorii Genetics and Genomics

2014 Climate Change Science Institute v Oak Ridge National Laboratory: Early Career Award

2014 Ekologická společnost Ameriky, cena za ekologii populace rostlin