Jeremy Johnson | Prescott College

Jeremy Johnson

Ph.D.
Academische verklaring

Ik raakte geïnteresseerd in bosecologie terwijl ik opgroeide in de buurt van de voorkant van de Rocky Mountains in Colorado. Na het afronden van mijn BS in natuurlijke hulpbronnen aan de Colorado State University heb ik een aantal jaren gewerkt voor de National Park Service en de US Forest Service (beide in Arizona) voordat ik een doctoraat in de geografie behaalde gericht op boslandschapgenetica aan de Texas A&M University. Ik heb posities bekleed als gasthoogleraar aan de Texas A&M University en doceerde biogeografie en heb een postdoctorale afspraak gehad bij Northern Arizona University in de School of Forestry en bij de USDA Forest Service in het Dorena Genetic Resource Center in Cottage Grove, Oregon waar ik mijn tijd kon doorbrengen omringd door de hoge bomen van de Pacific Northwest.

Ik ben een bos-ecoloog en geneticus met brede onderwijs- en onderzoeksinteresses gericht op het begrijpen van de ruimtelijke en tijdelijke patronen van hoe bossen reageren op meerdere bedreigingen die verband houden met wereldwijde ecologische verandering door me te specialiseren in het gebruik van geografische, landschaps-ecologische en genetische hulpmiddelen en theorie. Specifiek onderzoek ik patronen van plantbewegingen door zaadverspreiding, patronen van lokale aanpassing en natuurlijke genetische weerstand tegen invasieve bosziekten. Mijn doel is om het voortbestaan ​​van bossen op lange termijn te verzekeren met effectieve instandhoudingsinterventies en beheer door de volgende generatie ecologen en natuuronderzoekers op te leiden.

Educatie

2016 Ph.D., Texas A&M University

2011 MS, Texas A&M University

2004 BS, Colorado State University

Academische afspraken

2017-2019 Joint Postdoc, USDA Forest Service, Dorena Genetic Resouce Center / Northern Arizona University, school of Forestry

2016-2017 Gasthoogleraar aan de Universiteit van Texas, A&M, Afdeling Geografie

Publicaties

Wordt beoordeeld of herzien

Moler EV, Bucholz ER, Heck E, Johnson JS, Pagina GFM, Sniezko RA, Waring KM, Wehenkel C, Whipple AV. In beoordeling. Het zaad-herkomstklimaat en gesimuleerde klimaatopwarming beïnvloeden zaadeigenschappen van zuidwestelijke witte den. Canadian Journal of Forest Research.

Rogers H, Aslan C, Beckman N, Shea K, HilleRisLambers J, Fricke E, Bronstein J, Brodie JF, Bruna E, Bullock JM, Cantrell S, Decker R, Effiom E, Gurski K, Hastings A, Hartig F, Johnson JS, Kogan O, Loiselle BA, Miriti M, Neubert MG, Pejchar L, Poulsen JR, Powell JA, Pufal G, Razafindratsima OH, Sandor M, Schupp EW, Snell RS, Strickland C, Zambrano J, Zhou J, Zurell D. In beoordeling. Zaadverspreiding en zaadpredatie - ondergewaardeerde maar kritisch belangrijke processen. AoB planten.

LaRue EA, Dodds W, Rohr J, Dahlin K, Thorp JH, Johnson JS, Hardiman BS, Rodriguez-Gonzalez MI, Keller M, Fahey R, Knott J, SanClements M, Atkins JW, Tromboni F, Chandra S, Parker G, Rose K, Liu J, Fei S. Aanvaard. De evolutie van de biologie van macrosystemen. Grenzen in ecologie en milieu.

Gepubliceerd of in druk

2020

Sniezko RA, Johnson JS, Reeser P, Kegley A, Hansen E, Sutton W, Savin DP. 2020. Genetische weerstand tegen Phytophthora lateralis in Port-Orford-ceder (Californische cipres) - Basisbouwstenen voor een weerstandsprogramma. Planten, mensen, planeet. DOI: 10.1002 / ppp3.10081

Sniezko RA, Johnson JS, Savin DP. 2020. Beoordeling van de duurzaamheid, stabiliteit en bruikbaarheid van genetische resistentie tegen een niet-inheemse schimmelpathogeen bij twee soorten pijnbomen. Planten, mensen, planeet. DOI: 10.1002 / ppp3.49

2019

Rogers H, Beckman N, Hartig F, Johnson JS, Pufal G, Shea K, Zurell D, Bullock JM, Cantrell S, Loiselle B, Pejchar L, Razafindratsmia O, Sandor M, Schupp E, Strickland C, Zambrano J. In de pers De totale dispersiekern: een overzicht en toekomstige aanwijzingen. AoB planten.

Beckman NG, Aslan C, Rogers H, Kogan O, Bronstein J, Bullock JM, Hartig F, HilleRisLambers J, Zhou J, Zurell D, Brodie JF, Bruna E, Cantrell S, Decker R, Effiom E, Fricke E, Gurski K , Hastings A, Johnson JS, Loiselle BA, Miriti M, Neubert MG, Pejchar L, Poulsen JR, Powell JA, Pufal G, Razafindratsima OH, Sandor M, Shea K, Schupp EW, Snell RS, Strickland C, Zambrano J. 2019. Een interdisciplinair raamwerk bevorderen om de verspreiding van zaden te bestuderen. AOB planten.

Johnson JS, Pufal G, Cantrell S, Cosner C, Hartig F, Hastings A, Rogers H, Schupp EW, Shea K, Yu X, Zurell D. 2019. Snelle veranderingen in zaadverspreidingseigenschappen kunnen de reacties van de plant op wereldwijde verandering wijzigen. AoB planten. DOI: 10.1093 / aobpla / plz020 Editor's Choice

Aslan C, Beckman NG, Rogers H, Bronstein J, Zurell D, Hartig F, Shea K, Pejchar L, Neubert MG, HilleRisLambers J, Miriti M, Loiselle BA, Effiom E, Zambrano J, Schupp EW, Pufal G, Johnson JS, Bullock JM, Brodie JF, Bruna E, Cantrell S, Decker R, Fricke E, Gurski K, Hastings A, Kogan O, Powell JA, Razafindratsima OH, Sandor M, Schreiber SJ, Snell RS, Strickland C, Zhou J. 2019. Gebruik van functionele groepen van planten om de verspreiding en het behoud van zaaddispersie te bevorderen. AoB Planten. DOI: 10.1093 / aobpla / plz006 Editor's Choice

2018

Moler EV, Abakir A, Eleftheriou M, Johnson JS, Krutovsky KV, Lewis L, Ruzov A, Whipple AV, Rajora OP. 2018. Populatie-epigenomics: een beter begrip van fenotypische plasticiteit, acclimatisering, aanpassing en ziekten. In: Rajora OP, ed. Populatie-genomica: concepten, benaderingen en toepassingen: Springer. DOI: 10.1007 / 13836_2018_59

Johnson JS, Krutovsky KV, Rajora OP, Gaddis KD, Cairns DM. 2018. Voortschrijdende biogeografie door populatiegenomics. In: Rajora OP, ed. Populatie-genomica: concepten, benaderingen en toepassingen: Springer. DOI: 10.1007 / 13836_2018_39

2017

Johnson JS, Chhetri PK, Krutovsky KV, Cairns DM. 2017. Groei en de relatie tot individuele genetische diversiteit van berghemlock (Tsuga mertensiana) op alpine treeline in Alaska: combinatie van dendrochronologie en genomics. bossen, 8: 418. DOI: 10.3390 / f8110418

Balkenhol N, Dudaniec RY, Krutovsky KV, Johnson JS, Cairns DM, Segelbacher G, Selkoe KA, von der Heyden S, Wang IJ, Selmoni O, Joost S. 2017. Landschapsgenomics: begrip van relaties tussen milieuheterogeniteit en genomische kenmerken van populaties. In: Rajora OP, ed. Populatiegenomics-concepten, strategieën en toepassingen: Springer. DOI: 10.1007 / 13836_2017_2

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Konganti K, Krutovsky KV. 2017. Genomische landschapsinzichten in de historische migratie van berghemlock als reactie op de klimaatverandering van het Holoceen. American Journal of Botany, 104: 439-450. DOI 10.3732 / ajb.1600262 Omslagfoto

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Krutovsky KV. 2017. Zaadverspreiding bij alpiene boomgrens: een beoordeling van zaadbeweging binnen de ecotone alpiene boomgrens. Ecosphere, 8: e01649. DOI: 10.1002 / ecs2.1649 (Henry Cowles Award van de American Association of Geographers, jaarlijks toegekend aan een onderzoeker voor excellentie in een gepubliceerd onderzoekspaper in biogeografie)

2016

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Lafon CW, Krutovsky KV. 2016. Reacties van planten op wereldwijde verandering: biogeografie van de volgende generatie. Fysieke geografie, 37: 93-119. DOI: 10.1080 / 02723646.2016.1162597

2013

Johnson JS, Cairns DM, Houser C. 2013. Coastal Marsh Vegetation Assemblages of Galveston Bay: Insights for the Chenier Plain East Texas. wetlands, 33: 861-870. DOI: 10.1007/s13157-013-0443-8

Presentaties

Uitgenodigde gesprekken:

Johnson JS. "Wat zijn de kansen? - De interactie en impact van ziekte en klimaatverandering op zuidwestelijke witte dennen ontrafelen. 'Invited Talk May 1, 2019. Noordelijke Arizona University School of Forestry Seminar Series. Flagstaff, AZ

Johnson JS. "Bosgezondheid en genetica: overwegingen bij onderzoekontwerp" Uitgenodigd gesprek 20, 2019. California State University, Dominquez Hills, Afdeling Geografie, Carson, CA

Johnson JS. "Nieuwe grenzen in de bosbouw: combinatie van fenomics, gemeenschappelijke tuinen en landschapsgenomics om ziekteresistentie en klimaatverandering aan te pakken" Invited Talk Augustus 7, 2018. IUFRO International Workshop: Boomweerstand tegen insecten en ziekten: Promise in de praktijk brengen, Mt. Sterling, OH

Johnson JS. "Een multi-schaal beoordeling van zaadverspreiding met behulp van landschapsgenetica". Oregon State University College of Forestry, Department of Forest Ecosystems and Society, Corvallis, OF

Johnson JS. "Bossen in beweging: een landschapsgenetisch perspectief" Uitgenodigd gesprek September 15, 2017. Universiteit van Noord-Texas Afdeling Geografie en Milieu Seminariereeks "Crosscurrents", Denton, TX

Johnson JS. "Bossen onderweg". Uitgenodigd gesprek 3, 2017. Texas A&M University Department of Geography Spring Colloquium TV-Series, College Station, TX

Johnson JS. "Bossen onderweg". Uitgenodigd gesprek februari 6, 2017. California State University, Fullerton, serie geografie-seminars, Fullerton, CA

Johnson JS. “Het ontrafelen van de dispersiebeperking en genoomvariatie in drie bossoorten met behulp van een landschapsgenomica-benadering ”Invited Talk July 24, 2015. Landcare Research - Seminar Series, Landcare Research, Lincoln, Nieuw-Zeeland

Johnson JS. "Geografie aan de periferie: een geval van interdisciplinair onderzoek in het tijdperk van genomics." Lezing gepresenteerd op de bijeenkomst van de Texas A&M University Geography Society, april 8, 2014, College Station, TX.

Geselecteerde presentaties:

Johnson JS, Sniezko RA, Waring KM. 2019. Beoordeling van de duurzaamheid, stabiliteit en bruikbaarheid van genetische resistentie tegen een niet-inheemse schimmelpathogeen in vijf-naalds dennen. Paper gepresenteerd op de 15e tweejaarlijkse conferentie van wetenschap en management op het Colorado-plateau en de zuidwestelijke regio 9 - 12 september, Flagstaff, AZ

Johnson JS, Sniezko RA, Mackin H, Heck E, Lewine M, Brons D, Mccoy S, Kegley A, Page GFM, Haagsma M, Still C, Waring KM. 2019. Kenmerkend voor genetische weerstand tegen blisterroest in witte den in zuidwestelijke witte den. Papier dat moet worden gepresenteerd op de 2019 IUFRO Genetica van vijf naalddennen 22-26 Juli, Invermere, British Columbia, Canada

Johnson JS Bereik brede ruimtelijke patronen van grote genresistentie in zuidwestelijke witte den tot witte den blister roest. Paper gepresenteerd op de 2019 Noord-Amerikaanse bosecologie-workshop 23-27 juni, Flagstaff, AZ

Johnson JS, Waring KM, Wehenkel C, Leal Saenz A, Jacobs JJ, Sniezko RA. 2018. Het zit in hun genen - Identificatie van patronen van genetische weerstand tegen blaarroest in zuidwestelijke witte dennen. Paper gepresenteerd op de Society of American Foresters National Convention 3-7 October, Portland, OR

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM en Krutovsky KV. 2017. Behoudt verspreiding over lange afstand alpiene boomgrens? Paper gepresenteerd op Jaarlijkse conferentie van de American Association of Geographers, 5-9 April, Boston, MA.

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM en Krutovsky KV. 2016. Zaadverspreiding bij alpiene boomgrens: verspreiding over lange afstand handhaaft alpiene boomlijnen. Paper gepresenteerd op American Geophysical Union Jaarlijkse conferentie, 12-16 december, San Francisco, CA.

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Krutovsky KV. 2016. Historische reactie van berghemlock op pleistocene ijstijden bij zijn bereiklimiet in Alaska, VS. Paper gepresenteerd op IUFRO Genomics en Forest Tree Genetics Conference, 30 mei -4 juni., Arcachon, Frankrijk

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Konganti K, Krutovsky KV. 2016. Het ontwarren van Holoceen migratieprocessen van berg hemlock op het Alaskan Kenai-schiereiland. 1st Plaats: Biogeography Specialty Group Paper Competition. Paper gepresenteerd op de Jaarlijkse conferentie van de American Association of Geographers, 29 maart -2 april., San Francisco, CA

Johnson JS, Gaddis, KD en Cairns DM. 2015. Landschapsweerstand of isolatie op afstand: bosrespons op pleistocene ijstijden in Alaska. 2nd Plaats: Paper Competition. Paper gepresenteerd op TAMU GIS-dag, 17 november., College Station, TX

Johnson JS, Cairns DM en Gaddis, KD. 2015. Werp je lot in de wind: verspreiding over lange afstanden in Mountain Hemlock. Paper gepresenteerd op de South West Association of American Geographers Jaarlijkse conferentie, 4-7 november., San Antonio, TX

Johnson JS, Cairns DM, Gaddis KD, Krutovsky KV. 2015. Wie is je vader? Genomics demystificeert verspreiding op een boomgrens in Alaska. Paper gepresenteerd op Peth III: Mountains of Our Future, 4-8 oktober., Perth Schotland

Johnson JS, Cairns DM, Gaddis KD, Krutovsky KV, Konganti K. 2015. Genomica van langeafstandsdispersie in Hemlock in de bergen. Paper gepresenteerd op de Vereniging van Amerikaanse Geografen Jaarlijkse conferentie, 21-25 april., Chicago, IL

Johnson JS, Cairns DM, Krutovsky KV en Goldberg DW. 2014. Landschapsgenetica benaderingen in ecologische biogeografie: een case study met Douglas Fir (Pseudotsuga menziesii) in de Pacific North West. Paper gepresenteerd op de Vereniging van Amerikaanse Geografen Jaarlijkse conferentie, 8-12 april., Tampa, FL

Johnson JS, Cairns DM, Krutovsky KV en Goldberg, DW. 2013. Integratie van genetica en genomica in ecologische biogeografie: een case study met Douglas Fir (Pseudotsuga menziesii) in het noordwesten van de Stille Oceaan. Paper gepresenteerd bij de South West Association of Amerikaanse geografen jaarlijkse conferentie, 24-26 oktober., Nacogdoches, TX

Washington-Allen RA, Thompson SM, Hays DB, Delgado A, Li J, Brademan WT, Popescu S, Martínez Peña RM, Huber-Sannwald E, Brademan C, maart RG, Johnson JS, Modala NR, Reeves MC, Mitchell JE en Kulawardhana RW. 2013. Een overzicht van het gebruik van teledetectietechnologieën om drooglandproductie en -degradatie op lokaal tot mondiaal niveau te beoordelen. Paper gepresenteerd op de Mexicaanse Society of Ecology Conference, 18-22 maart., Villahermosa, Tobasco Mexico

Washington-Allen RA, Johnson JS, van Riper C, Modala N, Barnes M, Brademan C, Bruton R, Delgado A, Kim J, March R, Saenz N, Srinivasan S, Reeves MC. 2012. Monitoring en beoordeling van Amerikaanse drooglanden. Paper gepresenteerd op de American Geophysical Union Jaarlijkse conferentie, 3-7 december., San Francisco, CA

Johnson JS, Cairns DM en Houser C. 2012. Marsh vegetatie assemblages van de East Bay of Galveston Bay: een hiërarchische classificatie. Paper gepresenteerd op de Vereniging van Amerikaanse Geografen Jaarlijkse conferentie, 24-28 februari., New York, NY

Johnson JSen Cairns DM. 2011. Veranderende vegetatiedynamiek van een kustmoeras: Galveston Bay, Texas. Paper gepresenteerd op de Vereniging van Amerikaanse Geografen Jaarlijkse conferentie, 12-16 april., Seattle, WA

Geselecteerde posterpresentaties (*geeft de student-student aan):

Haagsma M, Page, GFM, Johnson JS, Still C, Waring KM, Sniezko RA, Selkor J. 2019 Objectieve identificatie van zieke planten uit hyperspectrale beelden met behulp van machine learning. Poster gepresenteerd op American Geophysical Union, 9-13 december, San Francisco, CA

Waring K, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M, Justin Bagley, Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Friedline C, Garms C, Heck E, Haagsma M, Johnson JS, Page, G, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M en Moler E. 2019. Aanpassing en acclimatisering van een boom aan ziekte en droogte. Poster gepresenteerd op NSF Macrosystems Biology PI-Meeting , 15-17 May, Boulder, CO

Haagsma M, Page, GFM, Johnson JS, Still C, Selkor J. 2018. Hyperspectrale beelden gebruiken om een ​​invasie-schimmelpathogeen te detecteren en de ernst van de symptomen te bepalen Pinus strobiformis zaailingen. Poster gepresenteerd op American Geophysical Union, 10-14 december, Washington, DC

Johnson JS, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M, Justin Bagley, Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Haagsma M, Heck E, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M, Moler E, Page G en Waring K. 2018. Aanpassing en aanpassing van een boom aan ziekte en droogte. Poster gepresenteerd op IUFRO 6th Internationale workshop over de genetica van boom-parasiet interacties: boomweerstand tegen insecten en ziekten: belofte in de praktijk brengen, 05-10 augustus, Mt. Sterling, OH

Waring K, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M, Justin Bagley, Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Friedline C, Garms C, Heck E, Johnson JS, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M en Moler E. 2018. Aanpassing en aanpassing van een boom aan ziekte en droogte. Poster gepresenteerd op NSF Macrosystems Biology PI-Meeting , 08-10 januari, Alexandria, VA

Waring K, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Friedline C, Garms C, Heck E , Johnson JS, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M en Moler E. 2017. Het combineren van ecologie en evolutie met behulp van opkomende technologieën om soortverdelingen te bepalen met een niet-inheemse pathogeen in een veranderend klimaat. Poster gepresenteerd op IUFRO: Bosregeneratie in veranderende omgevingen, 11-13 juli, Corvallis, OF

Gaur K*, Brandon Mann W*, Hou D*, Nolasco C*, McAfee L*, Hingrajiya K*, Johnson JS, en Chhetri PK. 2016. Boomring groeipatroon van Abies spectabilis van sub-alpine bos van Dhorpatan Hunting Reserve, West-Nepal. Poster gepresenteerd op South West Division van de American Association of Geography jaarlijkse conferentie, 20-22 oktober, Denton, TX

Johnson JS, Cairns DM, Gaddis en Konganti K. 2015. Gene flow op alpine treeline: waar komen die zaden vandaan? Winnaar: 1st plaats (categorie: Genetica en Genomica). Poster gepresenteerd op Texas A&M Institute for Genome Sciences and Society Symposium, 8-9 oktober., College Station, TX

Johnson JS, Cairns DM † en Krutovsky KV. 2014. Landschapsgenetica en genenstroom in Coastal Douglas-Fir (Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco var. menziesii. Poster gepresenteerd op MtnClim, 15-18 september., Midway, UT

Johnson JS, Krutovsky KV, Cairns DM en Goldberg, DW. 2014. Gen-stroom karakteriseren en visualiseren in Coastal Douglas-Fir (Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco var. menziesii): Een benadering van landschapsgenetica Poster gepresenteerd op Ecological Society of America Nationale conferentie, 10-15 augustus., Sacramento, CA

Johnson JSen Cairns DM. 2010 Vegetatieclassificatie van een kustzoutmoeras: Galveston Bay, Texas. Poster gepresenteerd op de South West Division van de Association of American Geographers Conference, 14-16 oktober., Tahlequah, OK

Awards, beurzen en onderscheidingen

Subsidies

2020-2021 USDA Forest Service - Werkzaamheid van grote genresistentie in een verwarmend klimaat voor vijf naalddennen. (Co-Pi met RA Sniezko) ($ 75,000)

2019-2021 USDA Forest Health Protection: Special Technology Development Project - Vroege identificatie van symptomen van witte dennenblaren door roest, door de ontwikkeling van een goedkoop fenotypeplatform met hoge doorvoer (PI, met Co-PI's K Waring, G Page, C Still, M Haagsma, J Selkor, R Sniezko) ($ 349,077)

2018 National Science Foundation - Onderzoekservaring voor studenten Supplement - Macrosystems Biology: Het combineren van ecologie en evolutie met behulp van opkomende technologieën om soortenverdelingen te bepalen met een niet-inheemse pathogeen in een veranderend klimaat: zuidwestelijke witte dennen (Pinus strobiformis) (Co-PI met PI C Still) ($ 6,750)

2015 National Science Foundation - Oost-Azië en Pacific Summer Institute Fellowship, Nieuw-Zeeland EAPSI: Beoordeling van zaadverspreidingsbeperking als een oorzaak van abrupte boomgrenzen in Nieuw-Zeeland ($ 9000)

2013-2015 National Science Foundation Doctoraatsproject Subsidieverbetering Grant - Geography and Spatial Sciences DDRI: Een genetische benadering van verspreiding op de ecotone alpine treeline (Co-PI, met DM Cairns) ($ 15,987)

2013-2014 Texas A&M Institute of Genome Sciences and Society Fellowship. Texas A&M University Een genomische benadering van zaadverspreiding bij de ecotone alpine treeline en de implicaties voor een veranderend klimaat ($ 22,000)

Awards

2018 Henry Cowles Award van de American Association of Geographers, jaarlijks toegekend aan een onderzoeker voor excellentie in een recent gepubliceerd onderzoekspaper in biogeografie: op een Zaadverspreiding bij alpiene boomgrens: een beoordeling van zaadbeweging binnen de ecotone alpiene boomgrens. Ecosphere

2016 Beste PhD Paper-presentatie: American Association of Geographers Biogeography Specialty Group

2015 Chimborazo PhD Student Research Award: American Association of Geographers Mountain Geography Specialty Group:

2015 Texas A&M Institute for Genome Sciences and Society beste presentatie in de categorie Genetica en Genomica

2014 Climate Change Science Institute bij Oak Ridge National Laboratory: Early Career Award

2014 Ecological Society of America, Travel Award voor plantenpopulatie